RXNFP தொகுதி நிறுவல்

Lucas Simon

வியாழன், 23 மே, 2024 ’அன்று’ பிற்பகல் 10:37:48

RXNFP நிறுவல் சிக்கல்களைச் சரிசெய்தல்
பைத்தானில் RXNFP தொகுதியை நிறுவுவது சவாலானது, குறிப்பாக செயல்பாட்டின் போது தொடர்ந்து பிழைகள் ஏற்படும் போது. அதிகாரப்பூர்வ வழிகாட்டுதல்களைப் பின்பற்றினாலும், சில பயனர்கள் தொடர்ந்து சிரமங்களை எதிர்கொள்கின்றனர், குறிப்பாக நிறுவலுக்கு பிப் அல்லது ஜிட் குளோனைப் பயன்படுத்தும் போது.
RXNFP தொகுதியின் நிறுவலின் போது ஏற்படும் பொதுவான பிழைகளை சரிசெய்தல் மற்றும் சரிசெய்வதற்கான விரிவான வழிகாட்டியை வழங்குவதன் மூலம் இந்த சிக்கல்களைத் தீர்ப்பதை இந்தக் கட்டுரை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது. சுற்றுச்சூழல் அமைப்பு, சார்பு மேலாண்மை மற்றும் புகாரளிக்கப்பட்ட பிழைகளுக்கான குறிப்பிட்ட தீர்வுகளை நாங்கள் உள்ளடக்குவோம்.

கட்டளை விளக்கம்

conda create -n rxnfp python=3.6 -y பைதான் பதிப்பு 3.6 உடன் 'rxnfp' என்ற புதிய கோண்டா சூழலை உருவாக்குகிறது

conda install -c rdkit rdkit=2020.03.3 -y குறிப்பிட்ட சேனலில் இருந்து RDKit தொகுப்பை நிறுவுகிறது

conda install -c tmap tmap -y TMAP சேனலில் இருந்து TMAP தொகுப்பை நிறுவுகிறது

curl --proto '=https' --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs | sh rustup ஐப் பயன்படுத்தி Rust நிரலாக்க மொழியை நிறுவுகிறது

source $HOME/.cargo/env தற்போதைய ஷெல் அமர்வில் ரஸ்ட் சூழல் மாறிகளை ஏற்றுகிறது

rustc --version ரஸ்ட் கம்பைலரின் நிறுவப்பட்ட பதிப்பைச் சரிபார்க்கிறது

pip install -r requirements.txt தேவைகள்.txt கோப்பில் பட்டியலிடப்பட்டுள்ள அனைத்து பைதான் சார்புகளையும் நிறுவுகிறது

python setup.py install அமைவு ஸ்கிரிப்டைப் பயன்படுத்தி பைதான் தொகுப்பை நிறுவுகிறது

RXNModel.from_pretrained("rxnfp_model") முன் பயிற்சி பெற்ற RXNModel ஐ ஏற்றுகிறது

கட்டளை	விளக்கம்
conda create -n rxnfp python=3.6 -y	பைதான் பதிப்பு 3.6 உடன் 'rxnfp' என்ற புதிய கோண்டா சூழலை உருவாக்குகிறது
conda install -c rdkit rdkit=2020.03.3 -y	குறிப்பிட்ட சேனலில் இருந்து RDKit தொகுப்பை நிறுவுகிறது
conda install -c tmap tmap -y	TMAP சேனலில் இருந்து TMAP தொகுப்பை நிறுவுகிறது
curl --proto '=https' --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs \| sh	rustup ஐப் பயன்படுத்தி Rust நிரலாக்க மொழியை நிறுவுகிறது
source $HOME/.cargo/env	தற்போதைய ஷெல் அமர்வில் ரஸ்ட் சூழல் மாறிகளை ஏற்றுகிறது
rustc --version	ரஸ்ட் கம்பைலரின் நிறுவப்பட்ட பதிப்பைச் சரிபார்க்கிறது
pip install -r requirements.txt	தேவைகள்.txt கோப்பில் பட்டியலிடப்பட்டுள்ள அனைத்து பைதான் சார்புகளையும் நிறுவுகிறது
python setup.py install	அமைவு ஸ்கிரிப்டைப் பயன்படுத்தி பைதான் தொகுப்பை நிறுவுகிறது
RXNModel.from_pretrained("rxnfp_model")	முன் பயிற்சி பெற்ற RXNModel ஐ ஏற்றுகிறது

RXNFP நிறுவல் சிக்கல்களைத் தீர்க்கிறது

Python இல் RXNFP தொகுதியை நிறுவும் போது ஏற்படும் பொதுவான சிக்கல்களைத் தீர்க்க வழங்கப்பட்ட ஸ்கிரிப்டுகள் வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளன. முதல் ஸ்கிரிப்ட் கோண்டா சூழலை அமைக்கிறது , உடன் தேவையான தொகுப்புகளை நிறுவுகிறது மற்றும் , மற்றும் RXNFP ஐ நிறுவும் முன் pip ஐ மேம்படுத்துகிறது pip install rxnfp. இது அனைத்து சார்புகளும் ஒரு பிரத்யேக சூழலில் சரியாக கையாளப்படுவதை உறுதிசெய்கிறது, மோதல்கள் மற்றும் இணக்கத்தன்மை சிக்கல்களைக் குறைக்கிறது. கூடுதலாக, சூழல் நிர்வாகத்திற்கு கோண்டாவைப் பயன்படுத்துவது RXNFP தொகுதியை கணினியில் உள்ள பிற பைதான் திட்டங்களிலிருந்து தனிமைப்படுத்த உதவுகிறது.

இரண்டாவது ஸ்கிரிப்ட் ரஸ்ட் கம்பைலரை நிறுவுவதில் கவனம் செலுத்துகிறது, இது டோக்கனைசர்கள் போன்ற சில தொகுப்புகளை உருவாக்குவதற்குத் தேவைப்படுகிறது. ரஸ்ட் உடன் பதிவிறக்கம் செய்து நிறுவுவதன் மூலம் இது தொடங்குகிறது பின்னர் ரஸ்ட் சூழல் மாறிகளை ஏற்றுகிறது . ரஸ்ட் கம்பைலர் சரியாக அமைக்கப்பட்டு, PATH கணினியில் அணுகக்கூடியதாக இருப்பதை இந்தப் படி உறுதி செய்கிறது. இறுதியாக, ஸ்கிரிப்ட் நிறுவலைச் சரிபார்க்கிறது மற்றும் பிரச்சனைக்குரிய தொகுப்பை மீண்டும் நிறுவ முயற்சிக்கிறது pip install tokenizers மற்றும் . இந்த வரிசை காணாமல் போன அல்லது காலாவதியான ரஸ்ட் கம்பைலர்களின் சிக்கலை நிவர்த்தி செய்கிறது, இது RXNFP இன் வெற்றிகரமான நிறுவலை செயல்படுத்துகிறது.

கோண்டா சூழலை அமைத்தல் மற்றும் RXNFP ஐ நிறுவுதல்

சூழலை அமைப்பதற்கான ஷெல் கட்டளைகள்

conda create -n rxnfp python=3.6 -y
conda activate rxnfp
conda install -c rdkit rdkit=2020.03.3 -y
conda install -c tmap tmap -y
pip install --upgrade pip
pip install rxnfp

rustup உடன் Rust Compiler ஐ நிறுவுகிறது

ரஸ்ட்டை நிறுவுவதற்கான ஷெல் கட்டளைகள்

curl --proto '=https' --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs | sh
source $HOME/.cargo/env
rustc --version
echo "Rust installed successfully"
pip install tokenizers
pip install rxnfp

GitHub களஞ்சியத்திலிருந்து RXNFP ஐ நிறுவுகிறது

GitHub இலிருந்து குளோனிங் மற்றும் நிறுவுவதற்கான ஷெல் கட்டளைகள்

git clone https://github.com/rxn4chemistry/rxnfp.git
cd rxnfp
pip install -r requirements.txt
pip install .
python setup.py install
echo "RXNFP installed successfully"

நிறுவல் மற்றும் சரிசெய்தல் சரிபார்த்தல்

நிறுவலைச் சரிபார்க்க பைதான் ஸ்கிரிப்ட்

import rxnfp
from rxnfp.models import RXNModel
print("RXNFP version:", rxnfp.__version__)
model = RXNModel.from_pretrained("rxnfp_model")
print("Model loaded successfully")
if __name__ == "__main__":
    print("Installation and verification complete")

RXNFP தொகுதியின் நிறுவலின் சரிசெய்தல்

RXNFP தொகுதியை நிறுவும் போது மற்றொரு பொதுவான பிரச்சனை, தேவையான அனைத்து கணினி-நிலை சார்புகளும் இருப்பதை உறுதி செய்வதாகும். RXNFP தொகுதியானது தொகுக்கப்பட வேண்டிய பல வெளிப்புற நூலகங்களைச் சார்ந்துள்ளது, இதற்கு இணக்கமான C++ கம்பைலர் நிறுவப்பட்டிருக்க வேண்டும். கூடுதலாக, RXNFP சார்ந்திருக்கும் சில பைதான் தொகுப்புகள் மூலத்திலிருந்து கட்டமைக்கப்பட வேண்டும், உங்கள் கணினியில் ஒரு செயல்பாட்டு உருவாக்க சூழல் தேவை.

இந்தத் தேவைகளை நிவர்த்தி செய்ய, உங்கள் மேகோஸ் அமைப்பில் Xcode கட்டளை வரி கருவிகள் நிறுவப்பட்டுள்ளதா என்பதை உறுதிப்படுத்துவது பெரும்பாலும் உதவியாக இருக்கும், இது அத்தியாவசிய மேம்பாட்டுப் பயன்பாடுகளை வழங்குகிறது. கட்டளையைப் பயன்படுத்தி இந்த கருவிகளை நிறுவலாம் . மேலும், மெய்நிகர் சூழல் அல்லது கோண்டா போன்ற ஒரு கருவியைப் பயன்படுத்தி இந்த சார்புகளை நிர்வகித்தல் மற்றும் தனிமைப்படுத்துவது சாத்தியமான முரண்பாடுகளைக் கணிசமாகக் குறைக்கும், இதன் மூலம் நிறுவல் செயல்முறையை ஒழுங்குபடுத்துகிறது மற்றும் பொருந்தாத சார்புகள் தொடர்பான சிக்கல்களைத் தவிர்க்க உதவுகிறது.

புதிய கோண்டா சூழலை எவ்வாறு உருவாக்குவது?
கட்டளையைப் பயன்படுத்தவும் பைதான் பதிப்பு 3.6 உடன் 'myenv' என்ற புதிய சூழலை உருவாக்க.
pip ஒரு தொகுப்பை நிறுவத் தவறினால் நான் என்ன செய்ய வேண்டும்?
முதலில், பிப்பைப் பயன்படுத்தி மேம்படுத்த முயற்சிக்கவும் . சிக்கல் தொடர்ந்தால், குறிப்பிட்ட சார்பு பிழைகளைச் சரிபார்க்கவும் அல்லது வேறு நிறுவல் முறையைப் பயன்படுத்தவும்.
MacOS இல் Rust ஐ எவ்வாறு நிறுவுவது?
கட்டளையைப் பயன்படுத்தவும் Rustup வழியாக Rust ஐ நிறுவ, ஒரு Rust toolchain நிறுவி.
RXNFP ஐ நிறுவுவதற்கு எனக்கு Xcode கட்டளை வரி கருவிகள் ஏன் தேவை?
Xcode கட்டளை வரி கருவிகள் தேவையான கம்பைலர்களை வழங்குகின்றன மற்றும் சில பைதான் தொகுப்புகளை மூலத்திலிருந்து தொகுக்க தேவையான கருவிகளை உருவாக்குகின்றன.
ரஸ்ட் சரியாக அமைக்கப்பட்டிருப்பதை எந்த கட்டளை உறுதி செய்கிறது?
நிறுவிய பின், இயக்கவும் ரஸ்ட் கம்பைலர் நிறுவப்பட்டுள்ளதா மற்றும் அணுக முடியுமா என்பதைச் சரிபார்க்க.
கோண்டாவைப் பயன்படுத்தி RXNFPக்கான சார்புகளை எவ்வாறு கையாள்வது?
புதிய கோண்டா சூழலை உருவாக்கி, சார்புகளை நிறுவவும் மற்றும் .
கட்டளை என்ன செய்கிறது செய்?
இது தேவைகள்.txt கோப்பில் பட்டியலிடப்பட்டுள்ள அனைத்து பைதான் தொகுப்புகளையும் நிறுவுகிறது, அனைத்து சார்புகளும் பூர்த்தி செய்யப்படுவதை உறுதி செய்கிறது.
GitHub இலிருந்து RXNFP களஞ்சியத்தை எவ்வாறு குளோன் செய்வது?
பயன்படுத்தவும் உங்கள் உள்ளூர் இயந்திரத்திற்கு களஞ்சியத்தை குளோன் செய்ய.
சக்கரம் கட்டும் போது பிழைகள் ஏற்பட்டால் நான் என்ன செய்ய வேண்டும்?
தேவையான அனைத்து கம்பைலர்களையும் நிறுவியிருப்பதை உறுதிசெய்து, பிப்பைப் புதுப்பிக்க முயற்சிக்கவும். உங்கள் இயக்க முறைமைக்கு குறிப்பிட்ட கூடுதல் உருவாக்க கருவிகளையும் நீங்கள் நிறுவ வேண்டியிருக்கலாம்.

RXNFP தொகுதியை வெற்றிகரமாக நிறுவுவது, சரியான சூழலை அமைப்பது மற்றும் அனைத்து சார்புகள் மற்றும் உருவாக்க கருவிகள் சரியாக உள்ளமைக்கப்படுவதை உறுதி செய்வதாகும். சுற்றுச்சூழலையும் சார்புகளையும் நிர்வகிக்க கோண்டாவைப் பயன்படுத்துவது திட்டத்தைத் தனிமைப்படுத்தவும் மோதல்களைத் தவிர்க்கவும் உதவுகிறது. கூடுதலாக, ரஸ்ட் கம்பைலர் மற்றும் பிற தேவையான கருவிகளை நிறுவுவது, தொகுப்பு தேவைப்படும் தொகுப்புகள் சீராக கையாளப்படுவதை உறுதி செய்கிறது.

இந்த வழிகாட்டியில் வழங்கப்பட்டுள்ள விரிவான படிகள் மற்றும் ஸ்கிரிப்ட்களைப் பின்பற்றுவதன் மூலம், பொதுவான நிறுவல் தடைகளை நீங்கள் கடந்து, RXNFP தொகுதியை உங்கள் மேகோஸ் கணினியில் இயக்கலாம். முறையான சூழல் அமைப்பு மற்றும் சார்பு மேலாண்மை ஆகியவை தடையற்ற நிறுவல் அனுபவத்திற்கு முக்கியமானவை.

RXNFP தொகுதி நிறுவல் பிழைகளை சரிசெய்வதற்கான வழிகாட்டி