Ağ grafiklerinin anlaşılabilir ve yapılandırılmış olması için düğümler tam olarak rgraphviz 'a konumlandırılmalıdır. POS özelliği manuel yerleştirmeye izin verse de, kullanıcılar sıklıkla düzgün bir şekilde işlev görmede zorluklarla karşılaşırlar. DOT dosyalarını güncelleme ve pin = true ile konumlar ayarlama gibi stratejiler kullanılarak tutarlı düzenler elde edilebilir. Proses iş akışları ve Bayes ağları gibi uygulamalar bu yöntemlerden büyük ölçüde yararlanır. Grafik tabanlı veri temsilinin önemli bir bileşeni olan doğru düğüm hizalaması yorumlanabilirliği ve görselleştirme kalitesini artırır.