iPad'deki dosyaları GitHub'a göndermeden önce şifrelemek, veri güvenliğini korumak için çok önemlidir. Dosya düzenleme ve aktarma içinworkingCopy uygulamasını kullanmak, şifrelemeyi doğrudan desteklemez. Ancak dosyaları şifrelemek için Python'un pyAesCrypt kitaplığını veya OpenSSL ile iSH uygulamasını kullanabilirsiniz. Ayrıca Cryptomator gibi üçüncü taraf uygulamalar, şifrelenmiş dosyaları bulut hizmetlerinde depolamak için güvenli çözümler sunar.