Linux VPS'de Gophish'i uygulamak, ortamın ayarlanması, uygulamanın çalışır durumda kalması için sistemin yapılandırılması ve işlevselliğin sağlanması için ayarların yapılması gibi bir dizi adımı içerir. Bu çabalara rağmen kullanıcılar şablon bağlantılarının doğru şekilde yönlendirilmemesiyle ilgili sorunlarla karşılaşabilirler.