Visual Studio Enterprise nima zmožnosti upravljanja več repozitorijev Git znotraj iste strukture map, kar je funkcija, ki je prisotna v VSCode. Kljub različnim poskusom, da bi to delovalo, kot je inicializacija več repozitorijev v eni sami mapi, uporabniki naletijo na težave pri dodajanju novih repozitorijev. Uporaba skriptov v PowerShell in Python lahko avtomatizira ta postopek, kar omogoča učinkovito ustvarjanje in inicializacijo več skladišč.