Prehod s SVN na Git je lahko izziv, zlasti če imamo opravka z več aplikacijami znotraj projekta IntelliJ. Vsak modul zdaj zahteva lastno oddaljeno skladišče Git, kar vključuje nastavitev posameznih skladišč Git in konfiguracijo IntelliJ za njihovo neodvisno upravljanje. Ta postopek vključuje inicializacijo Gita v vsakem modulu, dodajanje ustreznih oddaljenih repozitorijev in pravilno preslikavo imenikov v nastavitvah IntelliJ.