Pentru ca graficele de rețea să fie inteligibile și structurate, nodurile trebuie poziționate tocmai în rGraphViz . Deși caracteristica POS permite plasarea manuală, utilizatorii întâmpină frecvent dificultăți în a face să funcționeze corect. Aspecte consistente pot fi obținute prin utilizarea strategiilor precum actualizarea fișierelor DOT și setarea locațiilor cu pin = true . Aplicații precum fluxurile de lucru pentru proces și rețelele Bayesiene beneficiază foarte mult de aceste metode. O componentă crucială a reprezentării datelor bazate pe grafic, alinierea corectă a nodului îmbunătățește interpretarea și calitatea vizualizării.