Pāreja no SVN uz Git var būt sarežģīta, it īpaši, ja IntelliJ projektā tiek izmantotas vairākas lietotnes. Katram modulim tagad ir nepieciešams savs attālais Git repozitorijs, kas ietver atsevišķu Git repozitoriju iestatīšanu un IntelliJ konfigurēšanu, lai tos pārvaldītu neatkarīgi. Šis process ietver Git inicializēšanu katrā modulī, atbilstošo attālo repozitoriju pievienošanu un pareizu direktoriju kartēšanu IntelliJ iestatījumos.