Perėjimas nuo SVN prie Git gali būti sudėtingas, ypač kai IntelliJ projekte dirbate su keliomis programomis. Kiekvienam moduliui dabar reikia savo nuotolinės „Git“ saugyklos, kuri apima atskirų „Git“ saugyklų nustatymą ir „IntelliJ“ konfigūravimą, kad jas tvarkytų savarankiškai. Šis procesas apima „Git“ inicijavimą kiekviename modulyje, atitinkamų nuotolinių saugyklų pridėjimą ir teisingą katalogų atvaizdavimą „IntelliJ“ nustatymuose.