Mengenkripsi file di iPad sebelum memasukkannya ke GitHub sangat penting untuk menjaga keamanan data. Menggunakan aplikasi WorkingCopy untuk mengedit dan mendorong file tidak mendukung enkripsi secara langsung. Namun, Anda dapat menggunakan pustaka pyAesCrypt Python atau aplikasi iSH dengan OpenSSL untuk mengenkripsi file. Selain itu, aplikasi pihak ketiga seperti Cryptomator menawarkan solusi aman untuk menyimpan file terenkripsi di layanan cloud.