Az SVN-ről a Gitre való átállás kihívást jelenthet, különösen akkor, ha több alkalmazással foglalkozik egy IntelliJ projekten belül. Minden modulhoz saját távoli Git-tárra van szükség, amely magában foglalja az egyes Git-tárolók beállítását és az IntelliJ konfigurálását, hogy önállóan kezelje azokat. Ez a folyamat magában foglalja a Git inicializálását minden modulban, a megfelelő távoli tárolók hozzáadását és a könyvtárak megfelelő leképezését az IntelliJ beállításaiban.