Siirtyminen SVN:stä Gitiin voi olla haastavaa, varsinkin kun IntelliJ-projektissa on useita sovelluksia. Jokainen moduuli vaatii nyt oman etä-Git-tietovaraston, johon kuuluu yksittäisten Git-arkiston määrittäminen ja IntelliJ:n määrittäminen hallitsemaan niitä itsenäisesti. Tämä prosessi sisältää Gitin alustamisen jokaisessa moduulissa, sopivien etävarastojen lisäämisen ja hakemistojen yhdistämisen oikein IntelliJ:n asetuksissa.