SVN-ilt Gitile üleminek võib olla keeruline, eriti kui tegemist on mitme rakendusega IntelliJ projekti raames. Iga moodul nõuab nüüd oma Giti kaughoidlat, mis hõlmab üksikute Giti hoidlate seadistamist ja IntelliJ konfigureerimist nende iseseisvaks haldamiseks. See protsess hõlmab Giti lähtestamist igas moodulis, sobivate kaughoidlate lisamist ja kataloogide õiget vastendamist IntelliJ sätetes.