Η μετάβαση από το SVN στο Git μπορεί να είναι δύσκολη, ειδικά όταν ασχολείστε με πολλές εφαρμογές σε ένα έργο IntelliJ. Κάθε λειτουργική μονάδα απαιτεί πλέον το δικό της απομακρυσμένο αποθετήριο Git, το οποίο περιλαμβάνει τη δημιουργία μεμονωμένων αποθετηρίων Git και τη διαμόρφωση του IntelliJ ώστε να τα διαχειρίζεται ανεξάρτητα. Αυτή η διαδικασία περιλαμβάνει την προετοιμασία του Git σε κάθε ενότητα, την προσθήκη των κατάλληλων απομακρυσμένων αποθετηρίων και τη σωστή αντιστοίχιση των καταλόγων στις ρυθμίσεις του IntelliJ.