Azure B2C giver mulighed for omfattende tilpasning af brugergodkendelsesflows, herunder afsendelse af tilpassede MFA-bekræftelseskoder. Opsætning af tilpassede politikker for login på lokale konti og håndtering af brugsvilkår kan konfigureres problemfrit. Der opstår dog et almindeligt problem, hvor standard Microsoft lejer-e-mail sendes i stedet for den brugerdefinerede under MFA. Dette kan løses ved korrekt at konfigurere orkestreringstrin og kravtransformationer og bruge tjenester som SendGrid til at sende bekræftelseskoderne.

Integrering af forskellige godkendelse-metoder i Azure AD B2C, herunder telefon, autentificeringsapp (TOTP) og andre muligheder for multifaktorgodkendelse (MFA), øger brugersikkerhed og fleksibilitet. Konfigurationen involverer tilpassede XML-politikker, der giver brugerne mulighed for at vælge deres foretrukne metode, understøttet af en kompleks orkestrering af brugerrejser, der tilpasser sig dynamisk baseret på brugerens valg.