For at netværksgrafer skal være forståelige og strukturerede, skal noder placeres nøjagtigt i rgraphviz . Selvom POS -funktionen tillader manuel placering, støder brugerne ofte på vanskeligheder med at få det til at fungere korrekt. Konsekvente layout kan opnås ved at bruge strategier som opdatering af prikfiler og indstilling af placeringer med pin = true . Anvendelser såsom procesarbejdsgange og Bayesiske netværk drager stor fordel af disse metoder. En afgørende komponent i grafbaseret datrepræsentation, korrekt knudepligtig justering forbedrer tolkbarhed og visualiseringskvalitet.