Visual Studio Enterprise postrádá schopnost spravovat více úložišť Git v rámci stejné struktury složek, což je funkce přítomná ve VSCode. Navzdory různým pokusům, aby to fungovalo, jako je inicializace více úložišť pod jedinou složkou, uživatelé narážejí na potíže při přidávání nových úložišť. Pomocí skriptů v PowerShell a Pythonu lze tento proces automatizovat, což umožňuje efektivně vytvářet a inicializovat více úložišť.